应该起诉总公司，因为分公司不是的法人机构，不能作为法律主体。
分公司属于分支机构，在法律上、经济上没有性，仅仅是总公司的附属机构。分公司没有自己的名称、章程，没有自己的财产，并以总公司的资产对分公司的债务承担法律责任。
根据我国《公司法》第十四条第一款规定：“公司可以设立分公司。设立分公司应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。”
二、分公司的主要特征
1、分公司是由隶属公司依法设立的;
2、分公司没有自己的财产，与隶属公司在经济是统一核算，其在经营活动中的负债由隶属公司负责清偿。其实际占有和使用的财产是总公司财产的一部分，列入总公司的资产负债表中。
3、分公司不是公司，它的设立不须依照公司设立程序，只要在履行简单地登记和营业手续后即可成立。
4、分公司不承担民事责任，没有自己的章程，没有董事会等形式的公司经营决策和业务执行机关;
5、分公司没有的名称，其名称只要在总公司名称后加上分公司字样即可。